お話からすると喉に一時的に炎症が起きている可能性があります。痛みがあるというのは炎症を示唆しますが、この炎症は必ずしも感染症によるものとは限りません。頻繁に喉の痛みがある場合内視鏡検査等をして、一度しっかりと咽頭や食道の状態を検査しておくことをお勧めします。稀にですが憩室というものが食道の入口にできており、そこに炎症が起こるとお話されているような症状を起こすからです。おそらく今まで受診され、処方されていた薬は風邪を前提とした治療薬だったと思われます。ですので、心配される場合はもう一度担当の先生とよく相談され、必要であれば内視鏡等の検査も考慮してください。