痛いのは短くなった毛が皮膚を刺激しているのが原因なので、そこでさらに皮膚への刺激の強い脱毛クリームを使うのはさらに痛みを悪化させるリスクがあると思います。かぶれなどに塗るタイプのクリームをぬって、伸びるのを待つ方が良いと思いますが、気になるようでしたら皮膚科への受診をお勧めします。