絵の具を舐めてしまった

もえさん、こんばんは。
絵の具のついた手を軽くでも洗ったのであれば、絵の具を摂取してにしてもごく少量ですから健康被害はないと思います。
ご安心頂いて良いと思います。

爪の間に入ってて、それを仮に舐めていたとしても少量だから大丈夫ということですね？
→おっしゃるようにごく少量ですから問題にはならないと思います。

すべてのおもちゃを消毒したり洗ったりすることは難しいですので、可能な範囲・大変にはならない範囲で消毒や洗濯をすればよいと思います。
それよりも自宅に外からウイルスをなるべく持ち込まないようにすることが大切です。外から帰ってきた何も触らずにすぐに石鹸で手を洗う等にして頂くと良いと思います（もちろん赤ちゃんもです）。そうすれば風邪ウイルスの持ち込みを最小限にできると思いますので、おもちゃに風邪ウイルスが付着していてそれをなめることで風邪をひくという可能性を減らすことができると思います。
おもちゃの成分自体については基本的に発達段階に応じたおもちゃを与えていればなめて有害物質が溶け出すということはないと思います（特に乳児用のおもちゃは有害物質を用いずに製造されている場合がほとんどです）。

外から帰宅したら何も触らずにすぐ手洗いというのは風邪予防の上で非常に重要だと思いますから、今後のためにも是非覚えて実践してくださると良いと思います。
また何かあれば遠慮なくご相談ください。